Село Селиванова Гора известно с XV в., когда в жалованной грамоте великого князя Василия II упоминается как одна из деревень Киржачского Благовещенского монастыря. В 1653 г. здесь построена первая деревянная церковь Николая Чудотворца. В 1778 село Селиванова Гора вместе с бывшей монастырской слободой преобразованы в город Киржач. В конце XIX в. по обеим сторонам колокольни были построены каменные здания сторожки и церковноприходской школы . В советское время храм был закрыт и пришёл в запустение, уничтожено его внутреннее убранство. Длительное время здание использовалось под механические мастерские. Был разрушен купол колокольни, и после того, как он был восстановлен и собран на церковном дворе, вертолётчики Киржачского филиала института парашютостроения установили на колокольню собранный целиком купол с крестом.