С внешней стороны скалы в 100 метрах от входа расположена самая древняя церковь Гегарда – пещерная часовня Святого Григория, вырубленная в скале во второй половине XII века. С давних пор большинство монахов селились в пещерах, возвышавшихся над обителью – там обустраивались кельи и небольшие часовни. У входов во многие такие помещения до сих пор сохранились старинные резные хачкары, установленные в память о почивших обитателях.